蜥蜴与蛇的腺病毒感染
蜥蜴和蛇常见腺病毒感染。文献资料显示，腺病毒感染常发生于鬃狮蜥，但其他种类的蜥蜴也会感染。临床表现常常是非特异性。临床病变最常见的包含急性腹泻、厌食、角弓反张和幼龄蜥蜴死亡。有时，幼龄蜥蜴可能没有前驱症状而直接死亡。
其他种类的动物则表现出致命性肝炎或胃肠道病变。腺病毒感染引起的宏观病变经常不易察觉。在感染动物中，可发现嗜碱性核内包涵体，通常见于胃肠道上皮细胞、肝细胞和胆管上皮细胞。
在蛇中，蟒、游蛇科和蝰蛇科均可发生致死性肝炎或胃肠道疾病。临床症状包括反流、腹泻或中枢神经系统症状。爬行动物的传播途径目前尚不清楚。病变主要出现在肝脏和胃肠道，提示其很有可能通过粪口途径传播。生前诊断可通过粪便和泄殖腔拭子或肝脏活检进行PCR检测。
动物死后进行胃肠道和肝脏的组织学检查是本病的另一种诊断方法。
鬃狮蜥(Pogona vitticeps)肝脏，肝细胞细胞核内可见嗜碱性大包涵体
龟类疱疹病毒感染
疱疹病毒感染可导致各种龟类出现威胁生命的疾病，例如赫曼陆龟（Testudo hermanni）、欧洲陆龟（Testudo graeca）和四爪陆龟（Agrionemys horsfieldii）。本病可由易感个体之间直接接触进行传播。水平传播可能是爬行动物中最常见的传
播途径。垂直传播尚有争议。病理变化因物种和个体而异，可能包括胃肠道和呼吸道黏膜的溃疡性病变。此外，常见症状包括白喉、坏死性口炎和舌炎、坏死性支气管炎、肺炎和肝脏肿大。
在赫曼陆龟（Testudo hermanni）和豹纹陆龟（Testudo pardalis）中，幼龄动物患病后的死亡率可以接近100%。龟感染疱疹病毒的典型表现为组织中形成核内包涵体。为预防疾病的爆发，每只龟在引入幼龄动物群之前都应该进行疱疹病毒检测。可以采集咽部和舌部拭子或组织（舌、肝、脾、食道、肠道、气管、肺部、脑）进行聚合酶链式反应（PCR）检测来确诊。利用上述组织进行组织学检查或口腔拭子细胞学检查也可能观察到包涵体。应使用湿润的无菌棉拭子对病灶进行采样。采样后，取干净平滑的玻片，将拭子在其表面轻柔滚动。
赫曼陆龟（Testudo hermanni）的白喉-坏死性口炎和舌炎*
赫曼陆龟（Testudo hermanni）舌部，含有嗜酸性核内包涵体的上皮细胞
龟支原体病
阿卡西支原体（Mycoplasma agassizii）是一种导致上呼吸道疾病（URTD）的细菌。最早在感染后2周可能就出现临床症状，包括鼻部分泌物、结膜炎、眼部分泌物，以及眼睑和眼周水肿。需要注意，这些临床症状可能单独出现，也可能与其他症状同时出现。
支原体病主要的鉴别诊断包括疱疹病毒病和巴氏杆菌病。支原体病的传播途径是通过直接接触传染，尤其是当动物带有鼻部分泌物时。
阿卡西支原体黏附在龟类动物上呼吸道的纤毛粘膜上皮上，导致正常组织结构和功能严重受损。大体检查时无明显症状，或发现浆液性至黏脓性鼻部和眼部分泌物、结膜水肿和发红，以及眼睑和眼周水肿。组织学病变的严重程度可能差异很大，可能包括多灶性至局灶性大面积表皮下淋巴细胞聚积；混合细胞型炎性细胞浸润；基底细胞增生；黏膜和嗅觉上皮化生；以及纤毛上皮糜烂。诊断可通过PCR检测鼻腔灌洗液或者细菌培养样本中支原体染色体的DNA。鼻腔灌洗液应该用无菌容器装。
赫曼陆龟（Testudo hermanni）表现出结膜炎、眼部分泌物、严重的眼睑水肿和鼻部分泌物*
蛇副黏病毒病
副黏病毒引起的疾病特别常见于蛇类，但也可见于蜥蜴和龟类。这种病毒是蝰蛇的一种重要病原，但也可导致非蝰蛇发生病理性改变和死亡，涉及的蛇种包括眼镜蛇科、游蛇科、蚺科和蟒科。
当易感品种出现鼻部分泌物、张口呼吸、口腔蓄积干酪样物质和呼吸杂音时，应怀疑副黏病毒感染。此外，若蛇出现消瘦、肌肉张力消失、怠动、头部震颤、观星状姿势、热寻行为、反复发作且治疗无效的细菌性或真菌性肺炎、粘液性腹泻、粪便恶臭和肠管扩张、严重的原虫感染，也应怀疑副黏病毒感染。 临床病程可分为特急性、急性或慢性。呼吸道感染导致的宏观病变表现包括干酪样物质聚积在气管、鼻腔和肺部。这类病变更常见于蛇的慢性病例中。 组织学上见到II型肺泡上皮细胞增生伴有异嗜细胞和淋巴细胞浸润，可怀疑为副黏病毒病。在一些病例中可见合胞体细胞，蛇的慢性病例中常见间质纤维化。一些蛇会出现胰腺肿大，伴有导管上皮坏死或胰管增生。肝坏死、脓性肉芽肿性肝炎，神经学病变以脑内多灶性神经胶质过多症和血管套袖、脑干和脊髓近端的神经轴突纤维球样变性为特征。摄入污染物或直接接触带毒的呼吸道分泌物是最主要的传播途径。 对疑似病例进行分泌物、排泄物、口腔和泄殖腔拭子以及组织（肺部、肠道、肝脏和肾脏）样本进行PCR检测，可以确诊。
出血性肺炎和口腔出血的红尾蚺*
蛇反转录病毒感染
反转录病毒是引起蟒蛇包涵体病（IBD）的病原体。 IBD在家养的蟒蚺中很常见。临床症状包括头部震颤、角弓反张和翻正反射消失等中枢神经系统症状。
IBD相关的临床病变在种间和个体间有差异。然而，任何蛇，尤其是蟒，发生慢性消瘦、反流、粪便松散、口炎、溃疡性或坏死性皮炎、黏膜苍白、呼吸系统疾病、皮肤肿瘤和白血病，都应该怀疑IBD。出现这些症状时，可能伴有或不伴有中枢神经系统症状。大多数幼蛇表现出急性感染，死亡率可接近100%。成年蛇感染后症状更为持久，并导致虚弱。早期可能出现轻微的头部震颤、吐信缓慢和反应迟钝，随着疾病的发展，会出现厌食、昏睡、体重减轻和脱水。 蟒的病程发展比蚺更加迅速且严重。在蚺中，频繁反流是第一个症状，此后缓慢出现中枢神经系统症状，并在1-2年中逐渐恶化。患病的蚺可能吐出未消化完的食物，并在几周内死亡。该病在爬行动物中的传播途径鲜有记载。污染的气溶胶或排泄物可能是IBD的传播途径。 当感染的蛇被引入易感动物群后，疾病传播十分迅速。大批圈养蛇中可能通过蛇螨进行传播。IBD患蛇的典型表现是感染组织上皮细胞中出现嗜酸性胞浆内包涵体。包涵体在胰腺、肝脏、肾脏、脑和脊髓灰质中尤为常见。也可在肺泡上皮细胞、心脏、脾脏和神经细胞中发现包涵体。PCR技术尚不能用于诊断。 细胞学诊断建议选用血涂片（白细胞层）和食道黏膜的湿润无菌拭子。采集拭子样本后，应轻柔地沿着干净的载玻片表面滚动。之后在镜下观察涂片寻找包涵体。死前组织学诊断可选择肝脏组织活检样本。死后诊断时可选择胰腺、肝脏、肾脏、胃肠道黏膜和脑组织。
红尾蚺中枢神经系统症状，翻正反射消失，观星状姿态*
红尾蚺胰腺中所含的胞浆内嗜酸性包涵体
| | 症状 | 检测样本 | 检测时间 |
| 蜥蜴 | | | |
| 腺病毒 | 厌食，精神沉郁，腹泻，
角弓反张，肝肿大 | PCR: 粪便和泄殖腔拭子
组织学: 胃肠道，肝脏 | 2 - 3 天
2 天 |
| 蛇 | | | |
| 腺病毒 | 厌食，精神沉郁，腹泻，
肝肿大，反流，
中枢神经系统症状，
坏死性肝炎 | PCR: 粪便和泄殖腔拭子 | 2 - 3 天 |
| 副黏病毒 | 鼻部分泌物，张口呼吸，
口腔蓄积干酪样物质，
呼吸杂音，肺炎，
中枢神经系统症状（肌张力消失，
怠动，头部震颤，观星状姿态），
反复发作且治疗无效的细菌、
真菌和原虫感染 | PCR: 口腔和泄殖腔拭子
-死后检查: 组织样本（肝脏，胃肠道黏膜） | 2 - 3 天 |
| 反转录病毒IBD | 头部震颤，角弓反张，
翻正反射消失，沉郁，
吐信迟缓，
反胃等中枢神经系统症状，
口炎，渐进性肺炎 | 细胞学: 白细胞层血涂片，食道拭子涂片
组织学:
- 死前检查: 肝脏活检
-死后检查: 组织样本（肝脏，胰腺，肾脏，
胃肠道黏膜，脑组织，肺脏） | 1天
2天 |
| 龟 | | | |
| 阿卡西支原体 | 结膜炎，口腔或鼻腔分泌物，
眼睑和眼周水肿 | PCR : 鼻腔灌洗样本 | 2 - 3 天 |
| 疱疹病毒 | 厌食，沉郁，白喉和
坏死性口炎和舌炎，
坏死性支气管炎，肺炎，以及肝肿大 | PCR : 口腔拭子
死后检查: 组织样本（舌，肝脏，
脾脏，食道，肠道，气管，肺脏，脑组织） | 2 - 3 天 |
*病例大体表现照片已获得 "Gemeinschaftspraxis Rüschoff / Christian, Hamburg" 授权使用。